據中國科學技術信息研究所2012年12月發布的2012年版《中國期刊引證報告(核心版)》報道：《上海海事大學學報》核心影響因子為0.442，在43種交通運輸工程類期刊中排名第9，居航海類期刊第一；《上海海事大學學報》在中國科技核心期刊綜合評價中綜合評價總分為44.1分，排名列1998種中國科技核心期刊第553名，較2011年版的968名有大幅度提升。

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