上海海事大學外事處（港澳臺辦公室）成立于2005年5月， 2011年經學校批準更名為國際交流處（港澳臺辦公室），為學校直屬部門，歸口管理全校國際交流工作。

上海海事大學重視并不斷發展與國外（境外）的交流與合作，與分布在美國、加拿大、英國、荷蘭、法國、德國、波蘭、瑞典、丹麥、挪威、比利時、希臘、馬耳他、俄羅斯、烏克蘭、澳大利亞、加納、埃及、坦桑尼亞、肯尼亞、土耳其、日本、韓國、新加坡、印度尼西亞、馬來西亞、緬甸、越南等國家和地區的100多個院校建立了友好合作關系。上海海事大學與國際海事組織、波羅的海國際航運公會、國際海事大學聯合會、國際海事教師聯合會、英國皇家特許船舶經紀人協會等國際組織保持密切的合作關系；還與馬士基航運集團、日本郵船株式會社、丹麥諾登航運集團、美國福茂航運集團等境外著名航運機構建立了實質性的交流關系。

上海海事大學與國外知名大學聯合舉辦了多個中外合作辦學項目，學校大力發展學生海外學習實習項目，主要合作院校包括美國麻省海事學院、美國歐道明大學、英國普利茅斯大學、英國斯旺西大學、英國樸茨茅斯大學、法國南特大學等；學校每年聘請長短期外籍教師來校教授專業課或開設講座，且人數逐年增加。

經教育部批準，上海海事大學自2011年與加納中西非地區海事大學合作舉辦“物流管理”理學學士學位教育項目。